Структуру Академии составляют региональные отделения («Отделения«), филиалы и представительства. В составе Академии может быть только одно региональное отделение от одного субъекта Российской Федерации.
Отделения создаются в порядке, установленном законодательством, на основании решения о создании, принятого Президиумом Академии. Высшим руководящим органом отделения является Общее собрание членов отделения, созываемое не реже одного раза в год.
Структура отделения включает в свой состав: Председателя, заместителя(ей) Председателя, Ученого Секретаря, Ревизионную комиссию (Ревизора). Постоянно действующим руководящим органом отделения является Правление отделения — избирается Общим собранием сроком на пять лет и может быть переизбран на новый срок неоднократно. Правление отделения: распоряжается имуществом отделения, организует, готовит и созывает Общие собрания отделения, ежегодно отчитывается о работе отделения перед Общим собранием отделения и др.вопросы.
Деятельностью отделения руководит Председатель. Председатель избирается Общим собранием сроком на пять лет и может быть переизбран на новый срок неоднократно. Председатель отделения ежегодно представляет отчет о проделанной работе Президиуму Академии.
Ученый Секретарь отделения осуществляет руководство научной и организационной деятельностью отделения, готовит проекты решений Общий собраний, ежегодно отчитывается о своей работе перед Общим собранием отделения.
Ревизионная комиссия (Ревизор) отделения избирается Общим собранием отделения сроком на пять лет. Ревизионная комиссия (Ревизор) отделения следит за соблюдением руководящими органами отделения Устава Академии, осуществляет проверки финансовой деятельности отделения.
Филиалы и представительства создаются и открываются как на территории Российской Федерации с соблюдением требований действующего законодательства, так и на территории иностранных государств, в соответствии с законодательством этих государств, если иное не предусмотрено международными договорами Российской Федерации.