Конференция. Высшим руководящим органом Академии является Конференция Делегатов Отделений Академии («Конференция»). Конференция созывается решением Президиума Академии по мере необходимости, но не реже одного раза в пять лет.
Конференция может проводиться с использованием телекоммуникационных технологий в режиме телемоста с обязательным ведением протокола и обязательной видеозаписью всех выступлений и голосований.
Президиум. Президиум Академии избирается Конференцией сроком на пять лет. Количественный и персональный состав Президиума Академии определяется решением Конференции Академии.
Президент. Президент Академии избирается Конференцией сроком на пять лет и может быть переизбран на новый срок неоднократно. Президент является членом Президиума Академии.
ПРЕЗИДЕНТ АКАДЕМИИ — доктор технических наук, профессор Карпенко Михаил Петрович
Главный Ученый секретарь. Главный Ученый секретарь Академии избирается Конференцией по представлению Президента Академии сроком на пять лет и может быть переизбран на новый срок неоднократно. Главный Ученый секретарь является членом Президиума Академии.
ГЛАВНЫЙ УЧЕНЫЙ СЕКРЕТАРЬ АКАДЕМИИ — доктор военных наук, доктор исторических наук, профессор Письменский Геннадий Иванович
Члены Президиума. Членами Президиума Академии могут быть избраны только члены Академии. Члены Президиума могут быть переизбраны на новый срок неоднократно.
Ревизионная комиссия. Ревизионная комиссия является контрольно-ревизионным органом Академии и избирается Конференций Академии сроком на пять лет. Ревизионная комиссия Академии избирается в количестве не менее трех человек из числа членов Академии